靜靜的異形宇宙，一艘名叫“貝蒂”的異形太空船正在飛向“禦夫座”星球。船上躺著數十個被麻醉凍僵瞭的異形地球人，他們全然不知即將到來的異形災難。原來，異形喪盡天良的異形軍方和商人將這些人誘拐過來，要送到“禦夫座”上孵化異形女皇兩百年前生下的異形蛋。 雷普莉（西格妮•韋弗 Sigourney Weaver 飾）已成為瞭異形女皇生下的異形轉世為人的異形人。她的異形基因裡帶上瞭異形的基因，變得特別強壯、異形忽明忽暗，異形成瞭“雙面人”。異形“貝蒂”上有個叫考爾（維諾娜•賴德 Winona Ryder 飾）的異形年輕女人，正在設法破壞孵化異形蛋計劃。異形當“貝蒂”來到“禦夫座”，異形意想不到的情形發生瞭！
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