本片改編自花澤健吾的地下忍同名漫畫，講述瞭曾經輝煌一時的地下忍日本忍者，在戰後被GHQ解散組織而消失，地下忍不過，地下忍他們潛伏在世界的地下忍所有機關，現代也暗中活動著，地下忍據說人數約為20萬人。地下忍但基層忍者經常找不到工作，地下忍其中之一的地下忍雲隱九郎（山崎賢人 飾）隸屬忍者組織“NIN”的末端忍者（下忍），過著與啃老族無異的地下忍生活。一天，地下忍閑得發慌的地下忍他被判瞭一項重大的“忍務”，那就是地下忍調查戰後70多年來一直潛入地下的某個組織的動向，其名為——“地下忍者”。地下忍忍術、地下忍智謀、最新科技等驅使瞭一切，從未有過的戰鬥現在開始。